由于不同地区和不同机构导致高新技术专项认定审计的费用也会有所不同。
高新技术企业认定的审计包括：公司近三年的会计报表审计和高新专项审计报告（研发费专项审计及技术收入审计报告）
高新认定审计具体要求如下：
1、经具有资质并符合本《工作指引》相关条件的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用（实际年限不足三年的按实际经营年限）、近一个会计年度高新技术产品（服务）收入专项审计报告；
2、经具有资质的中介机构（北京税务师事务所）鉴证的企业近三个会计年度的财务报表（含资产负债表、利润及利润分配表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限）。
高新认定专项审计报告要求审计以下内容：
（一）近一个会计年度高新技术产品（服务）收入
1. 高新技术产品（服务）收入及其分项明细（见附表1）；
2. 技术性收入及其分项明细(包括：技术转让收入、技术承包收入、技术服务收入、接受委托科研收入等)（见附表1）；
3. 高新技术产品（服务）收入与技术性收入之和；
4. 高新技术产品（服务）收入与技术性收入之和占企业当年总收入的比例。
（二）近三个会计年度的研发费用分年度分项审计
1. 近三个会计年度的研发总费用、在中国境内发生的研究开发费用总额；
2. 近三个会计年度的研究开发费用总额占销售收入总额的比例；
3. 研究开发经费及其分年度分项明细（见附表2）。
三、专项审计报告要求对企业编制的附表1、附表2、附表3及编制说明发表专项审计意见。
四、中介机构应对企业高新技术产品（服务）收入及研发费用情况汇总表（见附表3）中企业填报的“销售收入”、“总收入”及其它指标的真实性和准确性予以复核。上海高企认定企业成长性评分
